曾经，在名为冬木的城市，七组魔术师与英灵展开了圣杯战争。但是，趁着第二次世界大战的混乱，某一个魔术师将圣杯强行夺走了。
又经过了数十年，象征圣杯的尤格多米雷尼亚一族脱离了魔术协会，宣言自己组织的独立。尽管愤怒的魔术协会派出了刺客，但却被对方召唤出的SERVANT全部解决掉了。
能够对抗SERVANT的只有SERVANT。圣杯战争的系统被变更，七对七的空前绝后大规模战争——圣杯大战爆发。
另一方面，作为圣杯大战审判的第十五位SERVANT——贞德·达尔克被召唤了出来。尽管她对于自己被召唤出来的事情抱有一些疑问，但还是奔赴了作为舞台的城市——图利法斯。
与《FATESTAYNIGHT》《FATEZERO》都有所不同的崭新世界。外典：圣杯战争，正式开幕!
